Episodio 1
En Baltimore, Chandler y su equipo se unen a la resistencia subterránea para intentar vencer a Amy Granderson. Mientras tanto, Slattery y la tripulación del Nathan James corren una carrera contra el tiempo para salvar a Tophet y recuperar el control del buque.
Episodio 2
Con ayuda de la resistencia, Chandler avanza con su plan de sabotear la planta de suministro de energía e infiltrarse en Avocet. Por su parte, la tripulación lucha por recuperar el control del barco y Granderson se queda sin alternativas.
Episodio 3
El Nathan James regresa a Norfolk con la misión de producir y distribuir la cura. Con su familia sana y salva a bordo del buque, Chandler envía a la tripulación en busca de sus seres queridos.
Episodio 4
La tripulación descubre en altamar un buque hospital que podría tener un laboratorio mejor equipado para Rachel. Pero nadie responde a las comunicaciones y ahora Chandler y sus hombres se enfrentan a un enemigo inesperado.
Episodio 5
Chandler remolca al grupo de sobrevivientes hallados a bordo del Solace y debe enfrentarse al enemigo más peligroso: un submarino nuclear inglés al mando de dos oficiales navales rebeldes, Sean y Ned Ramsey.
Episodio 6
Chandler rastrea a los Inmunes hasta el norte de Florida, mientras Rachel encuentra una fórmula secreta aún incompleta. El equipo de Chandler da con un complejo en donde se esconden los Inmunes bajo las órdenes de Sean y Ned.
Episodio 7
Mientras que en el mar Slattery intenta evadir al submarino, en tierra Chandler y su equipo se infiltran en el complejo de los Immunes. Allí conocerá a Jeffrey Michener, un funcionario del gobierno cercano a Sean pero que podría convertirse en aliado.
Episodio 8
Mientras Rachel sigue trabajando para reconstruir la fórmula perdida del doctor Hunter, Chandler busca revertir el lavaje de cerebro al que fue sometido Michener por parte de los Ramsey.
Episodio 9
Con la doctora Scott al borde de un gran avance, Chandler y su equipo van en busca de equipos y materiales necesarios para su laboratorio. De vuelta en la nave, los esfuerzos de Rachel para producir una cura que se extienda depende de Niels.
Episodio 10
Rachel busca conseguir una nueva versión de la cura, mientras una misteriosa muerte a bordo del barco obliga a Chandler a iniciar una investigación. El Nathan James se dirige a Nueva Orleans, sin saber que los Inmunes le tienen preparada una sorpresa.
Episodio 11
Sean Ramsey transmite un mensaje que involucra a la Marina en un desastre devastador. Ahora más que nunca, Chandler necesita infiltrase en el bando enemigo para recuperar la confianza del pueblo estadounidense.
Episodio 12
El Nathan James se encuentra atrapado entre los bloqueos creados por los Inmunes. Entretanto, Chandler envía a la Dr. Scott y la cura bajo la protección de Slattery.
Episodio 13
Ahora con su misión enfocada en difundir la cura, el Nathan James hace un llamado a la población a acercarse a los puertos seleccionados para recibir la cura. Pero no todo es tan fácil, ya que pequeños grupos de inmunes aún continúan su lucha por destruir la cura, y mantener vivos los sueños de Ramsey.